Anthropic 于台北时间 10 月 20 日公布一项研究,介绍其内部研究模型如何在 Claude Science 环境中,与财务研究机构 Citrini Research 合作,针对 5 种已知会危及人类的蝎子神经毒素,从零设计迷你结合蛋白(minibinder)。公司表示,整个设计流程主要由模型在约 64 小时内自主运行完成。
这 5 种毒素涉及墨西哥、巴西、北非和中东等地区。Anthropic 在文中提到,蝎蜇每年影响超过 120 万人,造成逾 3,250 人死亡,且常被归为投资不足的被忽视热带疾病。
Anthropic 同时反复强调,这次结果只验证了设计蛋白对重组毒素的结合,尚未进行细胞层级的中和验证,也没有开展动物保护试验,因此不宣称已经做出抗毒血清。
64 小时内完成 31 万余件设计
根据 Anthropic 研究摘要和同步公开的技术报告,模型在初始提示和 4 次后续指示下,调用了 12 套设计工具,产出 318,484 件蛋白质设计,并对约 553,052 组设计—毒素配对进行了共折叠筛选,整体计算量约为 1 万 GPU 小时量级。
在筛选阶段,Claude 先选出 180 件设计,团队随后在其协助下再补充 31 件,总计 211 件样本送交 Adaptyv Bio 与 Twist Bioscience,以表面等离子共振(SPR)检测其结合表现。
211 件送测中有 17 件达到标准
检测结果显示,211 件设计中有 17 件达到结合标准,而且全部只针对单一毒素有效。按毒素划分,Cn2 有 7 件达标,AaH II 有 4 件,AaH I 有 4 件,LqhIII 有 2 件,Ts1 则没有达标样本。
Anthropic 还披露,多毒素设计没有任何一件能同时对一种以上毒素达到标准。单毒素组共有 60 件,其中 11 件达标,命中率约为 18%。公司称,这一水平与典型蛋白质设计项目相近。
最强候选仍停留在结合验证阶段
在候选分子中,Cn2-B1 和 Cn2-B2 在两家实验室都表现出个位数奈摩尔级亲和力。竞争实验显示,这两种候选的结合位点可能与已知可中和 Cn2、且曾保护小鼠的抗体 LR 重叠或相邻。
不过,Anthropic 明确写道,这些结果仍不等于已经证明中和效果,因为公司尚未在细胞环境中验证其功能中和能力。
外部专家:这是第一步,药物开发仍很远
Anthropic 将结果交由外部专家 Susana Vázquez Torres 和 Timothy P. Jenkins 审视。两人都将这项工作视为有希望的第一步,同时指出,在动物毒液领域,真正的难点通常出现在结合之后,包括疗效、安全性、可负担性和可及性。
公司也再次提到双用途风险。Anthropic 表示,更自主的生物研究能力既可能加快疗法开发,也可能被滥用,因此相关蛋白质设计能力目前并未向普通用户全面开放。
Citrini 同日发布合作纪实,描述一个非专家团队如何在 Anthropic 的环境中,借助内部研究模型推进提示设计和送测流程,并同样强调功能中和验证尚未完成。
从 8 月基准测试走向被忽视疾病场景
Anthropic 将这次工作与 8 月的蛋白质结合蛋白研究作对比。相较此前在基准标靶上取得的较高命中率,这次项目转向商业激励较弱的蝎毒场景,用来测试 AI 是否能帮助非专家切入真实公共卫生问题。
这一路线属于从头(de novo)设计结合蛋白。Anthropic 称,据其所知,公开资料中尚无蝎毒 de novo 结合蛋白的先例。
公司指出,传统抗毒血清依赖动物免疫,周期长、成本高。即便计算设计可以缩短找到可信结合分子的时间,后续仍需完成毒液毒素验证、功能测试、动物保护试验和监管流程。Anthropic 与 Citrini 都将这些列为下一阶段工作,而不是已经完成的成果。
公开数据与后续观察点
就 AI 生物医药研究而言,这项工作的重点在于公开了可核对的结合数据和完整设计结果,把「代理式模型能否在数日内产出可送测候选」推进到可复验的层面。同时,官方也把「结合」与「抗毒血清或药物」明确区分开来。
后续值得关注的方向,包括细胞中和数据、动物保护数据,以及独立实验室是否能够复现相关数据集。


